Description intégrée de processus cellulaires spatiotemporels basée sur un modèle géométrique de transformation
L'observation de la dynamique spatiotemporelle d'objets biologiques déformables génère sous forme de séquences d'images une quantité énorme d'informations généralement sous-exploitées. Nous montrons dans cet article comment une analyse de ces séquences, basée sur un modèle paramétrique de transformation, permet de caractériser de façon originale les déformations de tels objets à partir d'un ensemble de topologies génériques. Celles-ci sont engendrées par un nombre réduit de paramètres décrivant la dynamique de l'objet et des processus biologiques sous-jacents. Cette représentation intégrée ramène l'analyse du processus biologique à l'étude de séries temporelles définies par les évolutions des descripteurs. Cette approche est illustrée, dans le cas d'une transformation affine, en considérant des séquences d'images issues de dynamiques intra à supra-cellulaires.
The observation of the dynamics of deformable biological objects generate through images sequences a huge amount of information, which usually remains only partly analysed. In this paper, we show how an analysis of such time-lapse sequences, with a parametric transformation model, insures an original characterization of deformations of biological objects from a set of generic topologies. Those are generated by a limited set of parameters describing the dynamics of such objects and of the underlying biological processes. This integrated description reduces the biological process analysis to the study of temporal series defined by the descriptors evolution. This approach is illustrated, when using an affine transformation, by considering experimental data on intra to supracellular dynamics.
P.TRACQUI, A.STÉPHANOU
Reçu le 20 octobre 2005.
Accepté le 19 octobre 2006.
séquence d'images, transformation affine, flot optique, descripteurs du mouvement, dynamiques auto-organisées.
time-lapse sequence, affine transformation, optical flow, motion descriptors, selforganised dynamics.
Français
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